O Laboratório de Fitoquímica conta com infraestrutura que permite preparar extratos de folhas, caules e raízes de plantas coletadas em reservas de Mata Atlântica e Cerrado do Estado de São Paulo, usando tecnologia de extração automática. Os extratos obtidos compõem a coleção denominada de “Extratoteca” (coleção de extratos) e são avaliados através de bioensaios de bancada quanto à sua atividade biológica.

No Laboratório de Fitoquímica também são extraídos óleos voláteis da flora aromática do Cerrado e Mata Atlântica, e sua composição e perfil químico são analisados por cromatografia líquida e gasosa, visando à identificação e o isolamento de compostos com potencial biotecnológico.